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科学的命名法 イタリック体は、以下のファミリーとのレベルで細菌およびウイルス分類群のために使用されます。 すべての細菌および多くのウイルスの遺伝子はイタリック体です。 サルモネラ菌の血清型は、斜体ではありません。 細菌、真菌、ウイルス以外の生物については、属レベル(家族、受注など)上記の分類群の学名はローマンタイプでなければなりません。 制限エンドヌクレアーゼのための略語は、それらが分離されている生物(通常は細菌)の名前に由来しているので、斜体にする必要があります。 SMA Iは、セラチア・マルセッセンスから単離しました。 PCRに使用されるTaqポリメラーゼは、サーマス・アクアティカスから単離しました。 ウイルス名で属と種のためのイタリック体を使用してください。 A /シグナスシグナス/ドイツ/ R65 / 2006 単数形で使用された場合の種、品種または亜種、属を斜体。 イタリック体でも複数で使用される場合属名を大文字にしないでください。 リステリア菌であります …リステリア菌です。 サルモネラ菌; マイコバクテリア S.(6亜種に分け)エンテリカとS. bongori:サルモネラ属は、わずか2種で構成されています。 EIDで遭遇するほとんどのサルモネラ菌はサルモネラ・エンテリカに属する血清型(血清型)になります。 ローマで最初にキャップされた血清型(例えばサルモネラ菌血清型パラチフス)に続く斜体の属と種を入れてください。 属速記“ S。” 種名を指定せずに使用すべきではありません 正:S. エンテリカ 正しい:S. エンテリカ血清型のネズミチフス菌 正しい:S. はSERを腸溶性。 ネズミチフス菌 誤:ネズミチフス菌 誤:S。 ネズミチフス菌 他の亜種に属する血清型は、亜種名の後にそれらの抗原式で指定されている(例えば、サルモネラ・エンテリカ亜種が60をdiarizonae:K:ZまたはS式IIIb 60:K:Z)。 1属についての記事では、著者は新しい種を導入するために略語を使用することができます。 私たちは、緑膿菌を検討しました。 P. プチダ、P。フルオレッセンス。 P. は脱窒菌。 それぞれが異なる略語を持つ複数の属についての記事では、著者は新しい種を導入するために略語を使用することができます。 私たちは、緑膿菌を検討しました。 化膿連鎖球菌。 P. プチダ。 そして、S. フェリス。 同じ略語を持つそのうちのいくつかは複数の属に関する記事については、新種の最初の言及を書き出します。 後で短縮します。 我々は、クルーズトリパノソーマとTriatoma infestansの間の関係を検討しました。 我々は、T。infestansのとのT. cruziの間の関係があることがわかりました。 同じ属のいくつかの種についての記事のために、属はタイトルだけでは抽象、テキスト、表、図中の最初の使用時にスペルアウトする必要があります。 続いて、それを他の種のために省略されることがあります。 私たちは、緑膿菌、P。プチダを検討しました。 P. フルオレッセンス。 場合&GTただし、; 1属は記事内の同じ文字で始まる、完全な属名は、それが新種で最初に使用された時にスペルアウトする必要があります。 種のその後の言及には、属を略記することがあります。 ダニは、オオカミに発見されました。 コヨーテ。 thous Cerdocyon。 そして、Chrysocyon brachyurus。 しかしC. のループスは、ダニの最大数を開催しました。 科、属、種、および様々なまたは亜種を斜体。 大文字で家族や属を開始します。 王国、門、クラス、順序、および亜目は大文字で始まるが、イタリック体ではありません。 、それは資産でも斜体でもない、生物のための一般的な複数が存在する場合(複数可Dorlandさん&rsquoを参照してください)。 ヒト型結核菌 家族マイコバクテリウム科。 放線菌目 マイコバクテリア バイナリ属種の組み合わせは常に、単数形で使用されています。 単独で使用される属(大文字及びイタリック体)は、通常、単数形で使用されているが、それは、その属内の全ての種を指す場合には、複数(イタリック体ではない)で使用することができます。 サルモネラ菌は… サルモネラ菌は、ユビキタス&hellipです。 MRSA分離株のためのスペースを使用しないでください。 Preferrred:USA300 避けてください:米国300 コクシジオイデス症を参照する際に、バレー熱、ないバレー熱を使用してください。 F”小文字&ldquoの使用; で“発熱” マニュアル伝染病での使用とし、リフトバレー熱のためのAMAスタイルと一致しています。 遺伝子の名称は、一般的にライターが遺伝子にまたは遺伝子と混同される可能性がある別のエンティティを参照しているかどうかを明確に役立つ、イタリック体されています。 遺伝子のスタイルは、生物に応じて異なります。 遺伝子と呼ばれるとき、彼らはイタリック体であることを除いて、マラリア原虫遺伝子の頭文字を描いたのスタイルには本当のコンセンサスはありません。 タンパク質と呼ばれるとき、そうではありません。 スタイルは、特定の雑誌に、より依存しています。 分子微生物学では、遺伝子や種略語、すなわちPF。 斜体で、用語の全ては小文字です。 pfmdr1。 pfatp6。 pvdhfr。 この特定の遺伝子はPfATPase6としてランセットに発表されました。 主なアイデアは、原稿全体で一貫してすることです。 遺伝子に言及する場合、マラリア原虫遺伝子の略語はイタリック体です。 タンパク質に言及するとき、彼らはイタリック体ではありません。 多くのウイルス遺伝子名はイタリック体で書かれており、伝統的な3文字、小文字、いくつかはすべて大文字で書かれてますが、ローマンされています。 明確なルールは、そのような遺伝子を命名するために存在していない、あなたは彼らが様々な異なる方法で説明が表示されます。 src遺伝子、myc遺伝子、HA、NA 細菌の遺伝子名は常にイタリック体で書かれています。 菌の遺伝子名は、一般的にウイルス遺伝子名(すなわち3斜体文字、小文字)と同じように扱われます。 多重遺伝子族では、数値の表記が含まれています。 同じ遺伝子の異なる対立遺伝子が指摘されている場合、用語は、上付き文字を可能にします。 MT”ミトコンドリアの遺伝子は、&ldquoを追加します。 または小文字であってもなくてもよい3または4文字の遺伝子に接頭辞。 薬物標的遺伝子はすべて、何のイタリック体をキャップしていません。 MSG 1、MSG 2、MSG 3(多重遺伝子) XYZ1(同じ遺伝子の異なる対立遺伝子) MT LSU(ミトコンドリア遺伝子) DHPSおよびDHFR(薬剤標的遺伝子) コレラ毒素遺伝子は、CTXとして書き込まれ、コレラ毒素サブユニットA遺伝子はctxAとして書き込まれます。 挿入配列は、&ldquo書かれています。IS” プラスイタリック体の数は(6110)です。 ヒトの遺伝子名はすべて大文字とイタリック体です。 理想的にはもう6文字以上、すべて大文字のラテン文字や大文字とアラビア数字の組み合わせなくてもよいです。 最初の文字は必ず文字です。 いいえ下付き、上付き文字、ローマ数字、またはギリシャ文字は使用されません。 類似の遺伝子名は、ヒトおよびマウスで存在してもよいです。 たとえば、スタイルのAMAマニュアルは、以下の遺伝子を示しています: &ベータ; 2 - ミクログロブリン:B 2メートル(マウス)およびB 2 M(ヒト) CD5抗原:CD5(マウス)およびCD5(ヒト) タンパク質は、ヒトを含む動植物を構成するアミノ酸の組み合わせは、多くの場合、遺伝子と同じ名前を持っていますが、イタリック体ではないされており、常に大文字で始まります。 例えば、ボレリアブルグドルフェリの外表面タンパク質の1は、それがOSP A(遺伝子)によってコードされた外表面タンパク質Aを命名し、タンパク質がのOspAです。 タンパク質は、多くの場合、一般的な名前(ガラクトシダーゼはLAC Zの遺伝子産物であるEG&ベータ版)を持っています。 タンパク質や遺伝子間の違いを見分ける方法? この用語は次の単語の1と組み合わされた場合、それはおそらく遺伝子を記述されています。 プロモーター([myc遺伝子の]例えば、P2のコアプロモーター); プロモーターは、遺伝子の部分ではないタンパク質であります ターミネーター、オペレーター、アッテネータサイト この用語は、次の単語のいずれかと組み合わされる場合、それはおそらく、タンパク質を記載されています。 抑制 - テストタンパク質が、doesnの&rsquo遺伝子を抑制する;トン。 反応 - テストタンパク質が反応し、遺伝子はdoesnの’トン ヘテロ二量化 上昇MYC” ____【著者は書く&ldquoするための共通の使用法に誤りがあるレベルの上昇; とき、彼ら意味:“ mycの高レベル”]。 MMRを斜体は、他の一般的な使用法に誤りがあります。 この意味&ldquo用語、;ミスマッチ修復、” 決して遺伝子、プロセスのためだけの略語です。 しかし、あなたが参照してください&ldquoがあり、MMR遺伝子の数の特定の変化を有するマウスは、開発&hellipされている;” 制限酵素 制限酵素は、それらが分離された細菌から、プラス一文字株指定(必要に応じて)、それが確認された順序を示すローマ数字の3文字の記号で識別されます。 3文字の細菌の指定は大文字で始まり、イタリック体であるべきです。 酵素名の残りの部分はローマン設定されています。 斜体はウイルス名を使用します このウイルスは、種ではありません。 ウイルスが種に属します。 分類学上の意味で使用された場合、ウイルスの種、属、家族を斜体。 それは特に1デングまたはよく知られているポリオのように、ウイルスの分類を言及しないように罰金であること、しかし、注意してください。 一般的に使用された場合、ウイルス名を斜体にしないでください。 あなたは(あなたがそれを大文字にしなければならないように、その中に適切な名前を持っているもの以外の)ウイルス名を大文字にした場合は、それをイタリック体にする必要があります。 ウシkobuviruses、kobuvirus、kobuvirusesが、Kobuvirus属。 西ナイルウイルスの存在は、蚊及び死んだカラスで確認されました。 (AMAスタイルガイド、P。758)。 西ナイルウイルス(WNV)&hellipの流行伝送;空中散布を促しました。 種西ナイルウイルスは、フラビウイルス属のメンバーです。 ブニヤウイルス科。 属Phlebovirus属。 種リフトバレー熱ウイルス 最近の注目は、(ブニヤウイルス科属Phlebovirus属種サシチョウバエ熱ナポリウイルス。。)トスカーナウイルスが注目されている国&hellipに。 頭字語は、ウイルス名に使用します それは、それを定義した後、ウイルス(例えば、WNVのための西ナイルウイルス)の頭字語を使用することが許されています。 しかし、(種西ナイルウイルスを含む)の種を短縮することはできません。 あなたがしなければ要するに、ドン&rsquoを斜体; tは頭字語を使用しています。 正しい:ウエストナイルウイルス(WNV;フラビウイルス科フラビウイルス属)は、種名は、ここでウイルスが送信されている[ヒトに伝達されません。 そう西ナイルウイルスは]ローマンタイプであり、略記することがあります。 ギリシャ文字で始まるウイルスについては、それを書いて、文字や単語の残りの部分との間のスペースを閉じます。 Betaherpesvirus ヒトコロナウイルスについて。 略語hCoVを使用しています。 ヒトコロナウイルスという名前の属/種が存在することに注意してください。 これは、Hコロナと略記されるべきです。 ないhCoV。 E13(EVを使用しないでください):番号のエコーウイルス(例えばエコーウイルス13)については、次の形式を使用します E型肝炎ウイルスについて。 acryonymのHEVを使用しています。 そうでない場合は著者や前例の指示がない限り、人間のウイルスの略語のための資本H(例えば、HMPV、ないのhMPV)を使用します(上記のヒトコロナを参照してください)。 人間のエンテロウイルスのために。 人間のEV、HEVを使用していません。 EV75:番号のエンテロウイルスの場合は、次の形式を使用します。 インフルエンザウイルスの場合は、別のセクション(以下、すなわち、次の西ナイルウイルス)を参照してください。 ポリオーマウイルスについて。 次のコマンドを使用します。 (以前のカロリンスカ研究所のポリオーマウイルスとして知られている)のKIポリオーマためKIPyV MCPyV、ないMCV、メルケル細胞ポリオーマウイルスのため、および (以前はワシントン大学のポリオーマウイルスとして知られている)WUのポリオーマためWUPyV。 パンデミックA(H1N1)2009ウイルス(http://www. who. int/influenza/gisrs_laboratory/terminology_ah1n1pdm09/en/index. htmlを参照)の用語の標準化のためのガイドラインを発表2011年10月18日、オン。 ガイドラインは、混乱を最小限に抑え、パンデミックA(H1N1)2009ウイルスの前に、ヒトで循環する古い季節A(H1N1)ウイルスからパンデミックウイルスを区別することを意図しています。 WHOのガイドラインと一致して、EIDはパンデミックA(H1N1)2009ウイルスは、以下の用語を使用します。 インフルエンザA(H1N1)pdm09ウイルス インフルエンザ、”単語&ldquoを含む完全なウイルス名の最初の言及した後、 それを使用するのに十分な&ldquoです;(H1N1)pdm09&rdquo ;; しかし、単語“ウイルス、” “感染、” または“流行” 必要に応じて、名前に追加されるべきです。 用語が頻繁に表示された場合は、略語“ pH1N1” 使用することができます。 EIDによって使用される他のインフルエンザウイルスの命名法の例: 鳥インフルエンザA(H7N9)ウイルス 鳥インフルエンザA(H5N1)ウイルス インフルエンザ、”インフルエンザA(H1N1)pdm09ウイルスについて上で述べたように、他のインフルエンザウイルス名は単語&ldquoを含む第1言及した後に短縮することができます。 しかし、必要に応じて、ワード単語“ウイルス、” “感染、” または“流行” 名に追加されるべきです。 例:(H7N9)ウイルス(H7N9)感染、A(H7N9)の流行。 それは次の&ldquoとき、HとNサブタイプは、常に括弧の中にあるべきであるインフルエンザ&rdquo ;: インフルエンザウイルスA(H5N1)(のための“インフルエンザウイルスサブタイプH5N1”) (H3N2)、V(のための“変異型インフルエンザA(H3N2)”) 単独で使用すると、サブタイプは、括弧は必要ありませんが、単語&ldquoを添付しなければならない;サブタイプ” H5N1亜型は&hellipです。 そのようなH5N1&hellipのような異なるサブタイプ、。 注意:H5N1型ウイルス、また病気でもありません。 それはあなたが記事の後半で何かをドロップする場合は、サブタイプの指定を省略することが単にインフルエンザウイルスA型のサブタイプの指定です。 唯一の1ウイルスが検討されている場合は、インフルエンザウイルスは、インフルエンザウイルスサブタイプH5N1意味方法で言うと、それ以降のサブタイプを残すことができます。 インフルエンザウイルス(H5N1)は、高または低病原性を有することができます。 高病原性"これは、&QUOT冗長ではありません。 タイトルインチ このウイルスの命名スタイルの詳細については、いくつかの国際機関によって採択され、ウイルス分類に関する国際委員会を参照してください。 インフルエンザウイルス分離株については、ウイルスのサブタイプを含む、完全に起源のホストを書き出す(人間ならば省略)、単離および歪み数のサイトが含まれ、ウイルスが2000年以降に分離された場合は4桁の年を使用します。 1900年代の間に分離されたウイルスは、2桁の年を使用します。 誤:DK /ラオス/ 3295/06 正しい:A /アヒル/ラオス/ 3295/2006 分離株名にホストの属と種を斜体。 A /シグナスシグナス/ドイツ/ R65 / 2006 インフルエンザウイルスの指定のための正式名称は、世界保健機関(WHO)によって改訂され、出版されました。 (WHOインフルエンザウイルスの命名のシステムのリビジョン:WHOの覚書をBull. World健康オルガン1980; 58; 585&ndashする; 9。。。)。 完全かつ正確な命名法は、ウイルス(A、B、またはC)の種類、(ヒトを除く)由来のホストは、隔離の地理的なサイト、ウイルスの菌株番号、分離の年(4桁の年を含み 2000年以降に分離され、2桁の年1900年代の間に分離されたウイルス)、およびサブタイプ(16可能Hおよび9の可能なN個のサブタイプ)のために。 このようにタイプが123の歪み番号とH5N1亜型とのメンフィステネシー州のマガモのアヒルから1995年に分離されたウイルスが指定されています: インフルエンザA /マガモ/メンフィス/ 123] / 95(H5N1)。 以下ではよく知られており、書き出さされていないPR(プエルトリコ)とFM(フォートモンマス)のようなサイトは、ヒトウイルスに短縮することができます。 使用するインフルエンザウイルスは、A / PR / 8/34(H1N1)、A / FM / 1/47(H1N1)、ならびにました /タイ/ SP-2004分の83(H5N1)。 低病原性鳥インフルエンザ”&ldquo用語を使用し、低病原性を持つ鳥インフルエンザウイルスに言及する場合、 ない“低病原性鳥インフルエンザ” 3回以上使用される場合、この用語は、LPAIと略記することができます。 高病原性を持つ鳥インフルエンザウイルスに言及する場合、用語&ldquoを使用し、高病原性鳥インフルエンザ&rdquoを。 ない“高病原性鳥インフルエンザ” 使用&GE場合は、3回は、この用語は、HPAIと略記することができます。 結論、調査結果、およびこのジャーナルに寄稿する作者による意見は、必ずしも米国保健社会福祉省、公衆衛生局、疾病管理予防センター、または著者の所属機関の公式見解を反映するものではありません 。 商号の使用は識別のみのためのものであり、上記の名前の基のいずれかを示唆するものではありません。
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